L'extraordinaire apogée de l'Etat athénien et la tentation de ses alliés de l'exploiter réveille les vieilles jalousies entre Sparte et Athènes. Ainsi, les deux cités se poussent à une rixe sanglante, qui entraîne dans son sillage la Grèce entière. La guerre du Péloponnèse commenc en 431 av. J.-C. et dure 27 ans. La fin de cette guerre, en 404 av. J.-C., voit la défaite des Athéniens qui abandonnent leur ville et leur hégémonie aux Spartiates. Chios, Lesbos, Corfou, la Céphallonie, Messine, Naupacte et l'Acarnanie sont les alliées d'Athènes. Celles de Sparte sont toutes les cités du Péloponnèse, à l'exception d'Argos. Durant toute la guerre, les habitants des communes de l'Attique s'installent à Athènes, ce qui engendre un très gros problème de logement et de conditions de vie.